转录组测序在病原宿主互作中的应用
作为一家面向全中国提供服务的NGS公司，我们有统计过客户项目的研究类型。结果我们发现，从事病原宿主互作研究的科研项目所占比例名列前茅。也许，你的项目也属于这个领域。无论你是做植物抗病研究，还是做鱼类白色念球菌感病实验，还是血吸虫在动物体内的侵染机理，这些领域本质上都属于病原宿主互作的范畴。
这个领域涉及物种就很广，宿主就包含人、动物、植物、微生物等，而病原也包括病毒、细菌、真菌等。漫长的进化历史，铸就了病原和宿主复杂的“撕逼”关系，所以众多生物学家都关注这个领域。实际上，病原宿主互作的分子机理本身是相当保守的，很多通路都已经报道，了解这些基础机理将有助于我们开展相关研究。所以，这是我们本期在线课堂关注的第一个问题。
病原宿主互作，本质上是病原-宿主的机体物质间（RNA、蛋白、代谢物等）的相互作用，而转录组测序则是研究这种互作关系的常用工具。如下图，无论是体内实验还是体外实验，当我们获得包含病原和宿主细胞的样本后，理论上就可以同时检测病原和宿主的RNA（也称为Dual RNA-seq），从而分析它们间的相互作用机理。但如何选择建库策略、推算足够的测序量、确定取样方式、采用合理的分析方法将直接影响转录组测序在你实验中的价值，甚至影响整个项目的成败。所以，这是我们本期在线课堂关注的第二个问题。
本期在线课堂，主要内容有：
病原宿主互作的原理解析
□ 病原宿主互作的分子机理
□ KEGG中相关pathway的解读
□ R基因类型以及结构解析
Dual RNA-seq应用于该领域的项目设计要点
□ 如何选择建库策略
□ 合理的测序量是多少
□ 在取样上，我们应该注意哪些问题
□ 都有哪些定制化生物信息分析策略有助于开展此类研究
交流时间：
12月21日（下周三）下午16：00
交流嘉宾：
周老师
报名地址：
https://ke.qq.com/course/141293#tuin=8e8efa7
另外，本期在线交流的PPT将会上传到论坛，大家可以关注论坛帖更新：
http://www.omicshare.com/forum/thread-1928-1-1.html
www.omicshare.com/forum
编程技巧/工具分享/教程视频/研究思路
这是一个生信交流、组学共享的开放平台，
我们梦想在未来，
OmicShare能助你达到更高的科研领域！