JCO：关于卵巢癌患者ctDNA基因突变检测的最新发现

高度浆液性卵巢癌（HGSC）患者种系BRCA1或BRCA2突变与良好的化疗反应相关。然而，次生基因内（回复）突变修复蛋白功能，从而导致临床上显著的获得性耐药率。本研究的目的在于确定是否能在循环系统中的游离DNA（cfDNA）中发现回复突变，从而预测HGSC的治疗反应。该研究于2017年2月13日在线发表于JCO（DOI: 10.1200/JCO.2016.70.4627）。

从30例BRCA1 或 BRCA2种系突变的HGSC患者中获取血浆和肿瘤样本。确定了两个队列：接受原发性HGSC减瘤术之前即为恶性肿瘤的患者（n=14）或复发患者（n=16）。大多数患者可获得配对肿瘤和血浆样本（30例中的24例）。靶向扩增，一种新一代测序技术，采用侧种系突变的引物进行，其设计不依赖于对既往逆转测序的认知。

5例患者被证实基因内突变且预测了恢复BRCA1/2open阅读框，包括2例具有多个独立逆转等位基因的患者。仅在复发患者（16例中的5例）的肿瘤样本和肿瘤检测逆转患者（5例中的3例）的cfDNA中检测到回复突变。对具有多个独立逆转等位基因的患者进行快速尸检，结果提示转移位点中的逆转等位基因频率是检验灵敏度的重要决定因素。通过测量TP53突变等位基因频率，总的游离DNA中充足的肿瘤衍生DNA，也影响着检验灵敏度。所有在肿瘤衍生DNA中检测到逆转的患者，对基于铂或多聚ADP核糖聚合酶抑制剂的化疗有抗性。

在对cfDNA的无偏倚分析中可以检测到回复突变，表明在复发HGSC中预测化疗反应具有一定的临床意义。